W skład Inspektoratu wchodzą następujące komórki organizacyjne:

1/ Wydział Inspekcji i Kontroli - WIK,

2/ Wydział Orzecznictwa Administracyjnego - WOA,

3/ Wydział Kontroli Wyrobów Budowlanych - WKWB

4/ Zespół d. s. Budownictwa Obronności i Bezpieczeństwa - SOB,

5/ stanowisko pracy:
a/ d.s. Organizacyjno – Administracyjnych - SOA,
b/ d.s. Obsługi Prawnej - RP,
c/ Głównego Księgowego - GK,
d/ d.s. Ochrony Informacji Niejawnych - IN.

- W skład stanowiska d.s. Ochrony Informacji Niejawnych wchodzą:
1) Pełnomocnik d.s. Ochrony Informacji Niejawnych,
2) Kierownik Kancelarii Tajnej,
3) Informatyk d.s. administrowania siecią.